1. aktivitāte „Citotoksiskās dabasvielas diazonamīda A totālās sintēzes noslēguma posma īstenošana”
Pārskata periodā turpināta diazonamīda A totālā sintēze. Darba gaitā veikta N-acilketona 8 iegūšana un optimizēti apstākļi tālākajai pārvērtībai par oksazolu. Veikta diazonamīda A totālajai sintēzei nepieciešamo būvbloku uzstrāde preparatīvos daudzumos.
2. aktivitāte „Citotoksiskās dabasvielas diazonamīda A fragamentu 15 un DZ-2384 totālās sintēzes noslēguma posma īstenošana”
Pārskata periodā veiksmīgi pabeigta DZ-2384 totālā sintēze, un iegūti 50 mg tīra parauga. Sintezēto vielu plānots izmantot par pozitīvo kontroli in vitro un in vivo pētījumos.
4. aktivitāte “Ligandu-mOAT mijiedarbības 3D modeļa izstrāde, balstoties uz strukturālās bioloģijas pētījumiem; 3D modeļa izmantošana jaunu mOAT inhibitoru un vienkāršotu diazonamīda A strukturanalogu dizainā”
Veikti DZ-2384 un tubulīna mijiedarbības pētījumi un uzsākta 3D modeļa izstrāde. Tubulīna un inhibitora DZ-2384 mijiedarbības molekulārā modeļa sagatavošana gaitā:
- veikts tubulīna trūkstošo fragmentu un proteīna sāņu ķēžu konformāciju aprēķins
- noteikts ūdeņraža saišu tīklas un tautomērās formas
- veikta modeļa optimizācija, izmantojot molekulārās dinamikas metodes
Veikta virtuālās skrīninga datubāzes sagatavošana, t. sk.:
- veikta “zinc” datubāzes filtrēšana un formāta pielāgošana
- veikta ligandu pamatstruktūras variēšana (scaffold hopping)
- veikta konformacionālā pārbaude (conformationalsampling) un farmakoforu filtrēšana
Publicēts: 05.09.2017.