Laboratorijas infrastruktūras izveide
Publisku iepirkumu konkursu rezultātā ir iegādāts zinātnisks aprīkojums šūnu bioloģijas laboratoriju izveidei. Visu jaunajai ēkai nepieciešamo zinātnisko iekārtu iegādes posms tiks pabeigts 2023. gada pirmajā pusgadā.
Studentu un viespētnieku uzņemšana
Erasmus studente Giorgia Bollo del Rio no Dženovas Universitātes (Itālija) pievienojās OSI Biotehnoloģiju grupai, lai no 2022. gada augusta līdz 2023. gada februārim strādātu pie sava maģistra darba tēmas.
Iesniegtie grantu pieteikumi
- 17.08.2022. ERA-chair līderis Dr. Emilio Parisini iesniedza FLPP granta pieteikumu: “Development of selective modulators of cadherin-mediated cell-cell adhesion”;
- 18.08.2022. Dr. Teodors Pantelejevs iesniedza FLPP granta pieteikumu “Investigation of the molecular mechanisms of homologous recombination”;
- 15.09.2022. iesniegts projekta pieteikums programmā International Emerging Actions IEA-2022: “INTERACT- Fibrous magneto-emissive materials toward fast and efficient bacteria trapping”. Divpusējs Francijas (Nantes Universitāte: Prof. Elena Ishow) un Latvijas (OSI: Dr. Rossella Castagna no Biotehniloģiju grupas) projekts.
Publikācijas
- Francesca Vasile, Francesca Lavore, Silvia Gazzola, Chiara Vettraino, Emilio Parisini, Umberto Piarulli, Laura Belvisi, Monica Civera. A combined fragment-based virtual screening and STD-NMR approach for the identification of E-cadherin ligands. Front. Chem. 2022, 10, 946087. DOI: 10.3389/fchem.2022.946087
- Nikhil Agrawal, Emilio Parisini. Early Stages of Misfolding of PAP248-286 at two different pH values: An Insight from Molecular Dynamics Simulations. Comput. Struct. Biotechnol. J. 2022, 20, 4892-4901. DOI: 10.1016/j.csbj.2022.08.060
- Rossella Castagna, Galyna Maleeva, Deborah Pirovano, Carlo Matera, Pau Gorostiza. Donor-Acceptor Stenhouse Adduct Displaying Reversible Photoswitching in Water and Neuronal Activity. JACS, 2022, 144, 34, 15595-15602. DOI: 10.1021/jacs.2c04920
- Nikhil Agrawal, Adam A. Skelton, Emilio Parisini. “A coarse-grained molecular dynamics investigation on spontaneous binding of Aβ9-40 fibril with cholesterol mixed DPPC bilayer”. Posted on BioRxiv, 2022. DOI: 10.1101/2022.09.16.508209.
Dalība konferencēs
Visa Biotehnoloģiju grupa, ieskaitot Erasmus+ studenti Giorgia Bollo del Rio, 2022. gada 22.–24. septembrī piedalījās Latvijas Organiskās sintēzes institūta rīkotajā starptautiskajā konferencē “2nd Drug Discovery Conference” (Rīga, Latvija):
- Dr. Emilio Parisini (Vadošais pētenieks / Biotechnoloģiju grupas vadītājs) “Towards the Development of Selective Modulators of Cadherin-mediated cell-cell Adhesion”;
- Dr. Nikhil Agrawal “Mechanism of PAP248-286 amyloid formation: an insight from molecular dynamics simulations”;
- Dr. Hajar Nika Estiri and Shapla Bhattacharya “Enzyme engineering of fructosyl peptide oxidase to widen its active site access tunnel and improve its thermal stability”;
- Dr. Rossella Castagna “A donor-acceptor Stenhouse adduct active in neuronal GABAARs and photoswitchable in water”;
- Dr. Teodors Pantelejevs “Targeting type II classical cadherins using fragment-based and peptidic approaches”;
- Ambreen Kauser “Plasmid identification and plasmid-mediated antimicrobial gene detection in Norwegian isolates”.
Šajā konferencē Dr. Teodors Panteļejevs ieguva vienu no 4 balvām par labāko stenda referātu. Šī balva, kuru sponsorēja žurnāls Crystals (MDPI), tika pasniegta par labāko sniegumu strukturālās bioloģijas dati.
Apmācību nodrošināšana, sadarbības līgumi un citi pienākumi
- Dr. Emilio Parisini tika iecelts par Boloņas Universitātes (Itālija) profesora asistentu – 01/09/2022.;
- Biotehnoloģiju grupas locekle Dr. Rossella Castagna pagarināja sadarbības pētniecības līgumu N 1.1. -5/28 ar Katalonijas Bioinženierijas institūtu uz 1 gadu līdz 2023. gada 10. oktobrim (Nr. 1.1. -5/51);
- Dr. Emilio Parisini kopā ar diviem citiem OSI kolēģiem (Dr. Aigars Jirgensons un Dr. Raivis Žalubovskis) uzsāka rūpniecisko sadarbību jaunuzņēmumu no Vācijas.
Apmācības un kursi
- Dr. Emilio Parisini bija Latvijas Organiskās sintēzes institūta organizētās “2nd Drug Discovery Conference” (Rīga, Latvija, 2022. gada 22.–24. septembris) orgkomitejas loceklis;
- 23.-25.08.2022. doktorantūras studentes Ambreen Kauser un Shapla Bhattacharya apmeklēja SPRINGBOARD vasaras skolu ” Major milestones in design and development of novel antimicrobials “, ko organizēja Eiropas Savienības pētniecības un inovāciju programmas “Apvārsnis 2020″ projekts ” Springboard for excellence in advanced development of antibacterials “/ Apšuciems, Latvija;
- 01. 09.2022. doktorantūras studente Ambreen Kauser pabeidza kursu ” Bioinformatics Level 1″, ko organizēja Seksjon for utvikling (UTS), Oslo universitetssykeus (OUS) & The National Graduate School in Infection Biology and Antimicrobials (IBA);
- ERA chair līderis Dr.Emilio Parisini organizēja 1 nedēļas kursu (2022. gada 5.-9. septembris) par molekulāro modelēšanu LOSI. Kursu, kas bija bezmaksas un pieejams visiem studentiem un pētniekiem (arī ārpus LOSI), vadīja vadošais eksperts šajā jomā Dr. Alfonso Gautieri (Milānas Politehniskā universitāte, Itālija). Kursā bija 5 teorētisko lekciju un 5 praktisku sesiju kombinācija. Tajā piedalījās vairāk nekā 25 dalībnieki;
- Doktorantūras studente Ambreen Kauser apmeklēja 1 nedēļas kursu “Practical Protein Bioinformatics” Lundas Universitātes (Zviedrija) Molekulāro proteīnu zinātnes centrā 12.-16.09.2022. (3 ECTS kredītpunkti).
Informatīvas darbības
Biotehnoloģiju grupas locekļi Dr. Nikhil Agrawal, Shapla Bhattacharya, Anastasija Rudņickiha, Laura Odiņa, Giorga Bollo del Rio un Dr. Rossella Castagna aktīvi piedalījās (t. i., sniedza informāciju sabiedrībai) pasākumā “Zinātnieku nakts”, kas 2022. gada 30. septembrī notika OSI. Šajā pasākumā piedalījās vairāk nekā 1000 cilvēku (gan bērni, gan pieaugušie) un OSI pētnieki veica demonstrācijas, sākot no ķīmijas eksperimentiem līdz 3D molekulārajai vizualizācijai.
Biotehnoloģiju grupas aktivitāšu popularizēšana sociālajos medijos
Tviterī:
- @osi_lv #Biodrug training course on Biomolecular Modelling organized by @emilio_parisini has just kicked off @osi_lv!! @AlfonsoGautieri will guide us on a week-long journey into #computationalbiology and #moleculardynamics. We can’t wait! (Apskatīt);
- Busy day @osi_lv for the #BioDrug training on Biomolecular Modelling held by @AlfonsoGautieri visiting the Biotechgroup invited by @emilio_parisini (Apskatīt)
Researchers’ Night 2022. Here we are @osi_lv #BioDrug #PhOAMS_project #WomenInScience (Apskatīt)
Publicēts: 31.07.2022.