Pārskata periodā paveiktais:
– Projekta mērķis ir atklāt jaunus enzīmus, kas katalizē šķērssaikņu veidošanos izvēlētos peptīdos, izmantojot C–H saites aktivāciju. Citohroma P450 enzīmi ievieš C–C, C–N vai C–O šķērssaiknes ribosomāli sintezētu un pēctranslacionāli modificētu peptīdu (RiPP) prekursoros.
Šim nolūkam mēs izmantojām Position-Specific Iterative Basic Local Alignment Search Tool (PSI-BLAST), lai meklētu homologas P450 sekvences, EFI-EST rīku kopīgo P450 sekvenču klasterizēšanai, kā arī Rapid ORF Description and Evaluation Online (RODEO) rīku kombinācijā ar manuālu analīzi, lai identificētu cieši saistītus prekursorpeptīdus.
– Iegūtais sekvenču līdzības tīkls tika izmantots, lai pētītu P450 proteīnus, kas saistīti ar RiPP biosintēzes ceļiem.
– Pašlaik esam atklājuši vairākus citohroma P450–RiPP enzīmus, kas spēj katalizēt šķērssaikņu veidošanās reakcijas peptīdos. Nākamais solis ir noteikt šķērssaistīto peptīdu struktūru, kā arī šo P450–RiPP enzīmu substrātu spektru.
Publicēts: 07.01.2026.