Pētniecības pieteikuma Nr. | 1.1.1.9/LZP/1/24/049 |
|---|---|
Pēcdoktorants | Dr. Kārlis Pleiko |
Zinātniskais konsultants | Prof. Aigars Jirgensons |
Projekta ieviešanas ilgums | 36 mēneši |
Projekta īstenošanas vieta | Latvijas Organiskās sintēzes institūts |
Kopējās projekta izmaksas | 184 140,00 EUR (ERAF finansējums – 156 519,00 EUR; attiecināmais valsts budžeta finansējums – 18 414,00 EUR; citi finansēšanas resursi – 9 207,00 EUR) |
Projekta zinātniskais mērķis ir izpētīt iespēju izmantot fāgu displeju mutlivalentu aptamēru atlasei pret mērķiem, kas saistīti ar vēzi, izmantojot NRP-1 kā proteīna mērķi koncepcijas pierādīšanas pētījumam.
Paredzētie projekta īstenošanas rezultāti:
- 1 zinātniskais raksts
Publicēts: 03.03.2024.
Pārskata periodā veiktas šādas pētnieciskās aktivitātes:
– himeriskā proteīna konstrukts, kurā fāga apvalka proteīns ir apvienots ar mērķa RNS saistošo proteīnu, tika izstrādāts in silico. Tika ņemtas vērā linkeru sekvences un kodonu optimizācija, lai nodrošinātu pareizu salocīšanos un ekspresiju E. coli šūnā;
– uzsākta mobilitāte Tartu universitātē;
– turpināts darbs pie himēriskā peptīdu fāga izveides. Baktērijas BL21 transformētas ar T7 fāga kapsīdas proteīna un Csy4 proteīna himērisko versiju saturošu plazmīdu. Pareizās nukleotīdu sekvences klātbūtne apstiprināta, izmantojot Sanger sekvencēšanas metodi;
– šobrīd norit apstākļu optimizācija (temperatūra, ilgums, tilpums), lai iegūtu iespējami augstāko himērisko fāgu titru;
– veikta vēl viena RNS saistošā proteīna dizainēšana, lai dotu iespēju izvēlēties optimālāko no abiem AptaPhage sistēmas izveidei.
Publicēts: 02.09.2025.
Pārskata periodā veiktas šādas pētnieciskās aktivitātes:
– turpināts darbs pie hibrīdas Aptaphage sistēmas izstrādes, izvērtējot divus RNS saistošus proteīnus – Csy4 un LS1 – un uzsākot atbilstoša RNS konstrukta izveidi;
– paralēli tika turpināts darbs ar LS1 proteīnu, kas specifiski saistās ar CS1 RNS struktūru;
– tika izstrādāti pirmie RNS konstrukta dizaini, kas ietver CS1 struktūru, ribozīmus RNS cirkularizācijai un reportieraptamēru signāla detekcijai
– kopumā pārskata periodā izdevās izveidot un eksperimentāli validēt funkcionējošu LS1 balstītu sistēmu un nodrošināt pamatu turpmākai hibrīdās Aptaphage platformas attīstībai.
Publicēts: 02.03.2026.
